Il supercomputer più veloce al mondo identifica le sostanze chimiche che potrebbero fermare la diffusione del coronavirus

Unirsi alla lotta contro il Coronavirus (COVID-19) è il “Summit” di computer più veloce e potente del mondo per aiutare a fermare la diffusione del virus mortale e sviluppare un vaccino contro di esso in una corsa contro il tempo.

Per chi non lo sa Vertice è un supercomputer sviluppato da IBM per l’utilizzo presso l’Oak Ridge National Laboratory (ORNL) del Dipartimento dell’Energia degli Stati Uniti, il cui obiettivo principale è consentire a scienziati e ricercatori di risolvere compiti complessi nei campi dell’energia, dell’intelligenza artificiale, della salute umana e altre aree di ricerca.

Può eseguire 200 quadrilioni di operazioni in virgola mobile al secondo (FLOPS), il che significa che è 1 milione di volte più potente del laptop più veloce.

Ai ricercatori ORNL è stato concesso un tempo di calcolo di emergenza al Summit, utilizzandolo per eseguire simulazioni con una velocità senza precedenti. Mentre il metodo tradizionale avrebbe richiesto ai ricercatori anni per essere completato, Summit è stata in grado di scoprire i composti del farmaco nello spazio di soli due giorni. secondo un rapporto della CNN.

Il progetto è stato in grado di identificare e studiare 77 potenziali composti farmacologici di piccole molecole per combattere COVID-19.

I ricercatori dell’Oak Ridge National Laboratory hanno utilizzato Summit per eseguire simulazioni di oltre 8.000 possibili composti per rilevare quelli che hanno le maggiori possibilità di avere un impatto sulla malattia, legandosi alla principale proteina “spike” del coronavirus, trasformandola in incapace di infettare le cellule ospiti. Hanno classificato i composti di interesse che potrebbero essere utili negli studi sperimentali del virus.

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“Ci sono voluti uno o due giorni, mentre tradizionalmente ci sono voluti mesi su un normale computer”, ha detto Jeremy Smith, direttore del Center for Molecular Biphysics presso l’Università del Tennessee / ORNL e ricercatore principale dello studio.

I risultati sono stati recentemente pubblicati in un articolo disponibile sul server di prestampa. ChemRxiv.

Perché serve un supercomputer per combattere il coronavirus

I virus infettano le cellule legandosi ad esse e utilizzando un “picco” per iniettare il loro materiale genetico nella cellula ospite. Il compito di Summit è identificare i composti farmacologici che potrebbero legarsi a quel picco e potenzialmente impedire al virus di invadere le cellule umane.

Sebbene Summit abbia fornito il primo passo nell’analisi, che è identificare i composti promettenti che i ricercatori devono seguire, non vi è alcuna garanzia che nessuno dei composti trovati dal supercomputer sarà efficace nella pratica. Il trattamento richiederà ancora test approfonditi e studi clinici per scoprire quali sostanze chimiche funzionano meglio contro il virus.

“I nostri risultati non significano che abbiamo trovato una cura o un trattamento per COVID-19”, Jeremy Smith, direttore del National Laboratory Center for Molecular Biophysics presso l’Università del Tennessee / Oak Ridge, in una frase.

“Tuttavia, siamo molto fiduciosi che i nostri risultati computazionali informeranno gli studi futuri e forniranno una struttura che gli sperimentatori utilizzeranno per indagare ulteriormente su questi composti. Solo allora sapremo se qualcuno di loro possiede le caratteristiche necessarie per mitigare questo virus ”.

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